神学院是装备信徒及教会领袖的神学教育机构，澳神更致力于培训教牧人才。好牧人必须具备圣经所记属灵领袖的条件，因此之故，学院强调的是全人教育，包括灵性的培育、知识的培育和品格的培育。是以在课程的设计上，注重学生三方面的培养：
1. 灵性的培育 (spiritual formation)
- 透过老师的生命榜样，属灵经验分享和提点，帮助学生灵命成长，激发他们对事奉的热诚。
- 通过每周的学院早会，师生一同敬拜，提升学生的灵性。
- 借着隔周的学院祈祷会，师生一同祷告，培养亲近神的热忱。
- 借着隔周的灵命指导时刻，由资深牧者带领学生追求灵命进深。
- 通过每年的宣教周和师生退修营，激励学生作灵命成长的追求。
2. 知识的培育 (intellectual formation)
- 本院致力物色和储备学有专长的老师负责教授不同范畴的科目，包括圣经、系统神学和基督教历史、教牧和圣工等。
- 另聘华人神学老师为特约讲师，教授其专长科目，协助提高学生的学术水平。
- 定期举办神学讲座，深化学生的神学知识。
- 致力于优质的教导、学习以及严谨的学术和研究。
- 增加图书馆藏书，并与其他神学院图书馆连线，丰富学生的研究资源。
- 订阅基督教刊物、学术期刊、杂志等，拓阔学生的知识领域。
3. 品格的培育 (character formation)
- 透过个人成长课程和老师的言传身教，再加上个别辅导，塑造学生的品格。
- 提供学院生活指引和执行学院的纪律，借以培养学生的高尚品格。
- 透过每周的师生早茶和午膳交通等群体生活，建立学生的品格。
- 借着隔周的灵命指导时刻，由资深牧者培育学生的品格。
- 通过每学期的教会实习和每年的宣教周，锻炼学生的品格。